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Nuclear N-glycosylation maintains H3K9me3 heterochromatin and genomic stability

Nature Cell Biology | 28 April 2026
First Author: Xiuxiao Tang
Corresponding: Junjun Ding
亮点
1.传统观点认为多糖仅存在于分泌途径和细胞表面,其在细胞核内的分布与功能此前尚不明确。
2.研究利用GlycoChIP-seq和位点特异性糖蛋白质组学技术,在多种细胞类型的核内膜蛋白上鉴定了N-糖基化修饰。
3.该修饰通过招募甲基转移酶SETDB1至核外周以维持H3K9me3水平,从而抑制LINE-1逆转录转座子活性,保障基因组稳定性。
Cover/Figure
研究摘要

数十年来,生物学界普遍认为多糖的功能局限于分泌途径。这些在内质网(ER)和高尔基体中合成的复杂糖链,被认为仅在细胞表面或胞外基质中发挥作用,介导细胞间通讯和信号转导。然而,发表在《自然-细胞生物学》(Nature Cell Biology)上的一项突破性研究打破了这一传统的亚细胞分布教条。该研究揭示,N-连糖基化(N-glycosylation)不仅存在于细胞核内,而且是异染色质结构维持和基因组稳定性的关键调节因子。

研究团队利用StrucGP软件进行的位点特异性糖蛋白质组分析,在多种细胞类型(从全能样干细胞到分化成纤维细胞)中鉴定出内核膜(INM)蛋白(包括SUN1、SUN2、TMPO和LEMD3)存在高甘露糖型N-糖修饰。为了绘制这些修饰在基因组上的分布图谱,研究人员开发了基于凝集素的染色质免疫共沉淀技术(GlycoChIP-seq)。结果显示,N-糖基化显著富集在核纤层结合结构域(LADs)中,这些区域通常是转录抑制区,并带有H3K9me3表观遗传标记。

通过药理学抑制寡糖转移酶(OST)复合物以及对特定N-糖基化位点(如TMPO的N289位点)进行定点突变,研究者阐明了核内N-糖基化的功能意义。研究发现,N-糖基化的缺失会导致LADs区域内的H3K9me3水平显著下调。在分子机制上,INM蛋白的N-糖基化促进了组蛋白甲基转移酶SETDB1在核周的招募和稳定。当糖基化受阻时,TMPO与SETDB1之间的相互作用减弱,导致SETDB1从核膜重新分布到核质中,从而无法维持H3K9me3异染色质状态。

这种表观遗传状态的破坏对基因组产生了严重后果。研究强调,由N-糖基化调节的H3K9me3对于沉默逆转录转座子(特别是长散在核元件-1,LINE-1)至关重要。抑制N-糖基化或突变TMPO糖基化位点会导致LINE-1元件重新激活,引起逆转录转座活性增强,并导致双链DNA断裂增加(表现为γH2A.X病灶增多)。这表明N-糖基化是维持基因组稳定性的一种此前未被认识的保护机制。

在探讨这些核内糖链的生物合成来源时,作者证明了内质网中的经典合成机器负责修饰INM蛋白。这些蛋白在内质网中完成糖基化,随后通过由atlastin介导的扩散以及特定核孔蛋白辅助的核孔复合物(NPC)转运到达内核膜。这项研究不仅将多糖的功能范畴扩展到了细胞核调控领域,还为细胞代谢(特别是葡萄糖驱动的糖基化)与表观遗传景观维持之间提供了全新的联系。通过确定N-糖基化作为异染色质稳定性的支柱,该研究为理解代谢紊乱如何导致基因组不稳定和表观遗传失控相关疾病开辟了新途径。

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